No te puedo ayudar mucho, pero si he escuchado algún caso de permuta entre municipios de distintas Comunidades Autónomas con diferentes subgrupos y no han tenido problemas, eso sí, los compañeros tenían que tener la titulación requerida por el municipio de destino.
Si vas a pasar de un C2 al C1 con la permuta, si no tienes bachiller o similar, se supone que te la rechazan.